NISA口座での損失を、一般口座や特定口座と損益通算することはできますか？

NISA口座での譲渡はすべて非課税になりますので、例え、損失があっても税制上損失とはみなされません。
また、NISA口座での損失は、特定口座（特定預り）や一般口座（一般預り）等、他の口座の利益との損益通算や、損失の繰越控除はできません。